В Иркутске создают комплекс для полного анализа геномов обитателей озёр и рек

Учёные планируют на новом уровне выявлять и моделировать изменения в сообществах микроорганизмов

Лимнологический институт (ЛИН) и Институт динамики систем и теории управления (ИДСТУ) Сибирского отделения РАН начали совместный проект по изучению геномов обитателей пресноводных экосистем - бактерий, водорослей, архей. Как рассказал научный сотрудник ИДСТУ СО РАН Алексей Шигаров, результаты проекта позволят на новом уровне выявлять и моделировать изменения в сообществах микроорганизмов, передаёт ТАСС.

- Мы планируем объединить методы массового секвенирования (определения нуклеотидной последовательности ДНК и РНК - прим.) и технологии обработки больших данных, чтобы получить представление о том, как меняются пресноводные экосистемы при изменении факторов окружающей среды. Результаты проекта могут быть применены для полной характеристики сообществ микроскопических организмов из разных мест обитания и для моделирования изменений в этих сообществах, - сказал Шигаров.

По словам доктора биологических наук, сотрудницы ЛИН СО РАН Елены Лихошвай, в рамках проекта будут максимально полно изучаться такие микроскопические организмы, как водоросли, бактерии, археи, и учитываться все факторы водной среды, влияющие на сообщества - температура, кислотность. Сейчас ученые располагают образцами из озер Байкал и Лабынкыр (Якутия).

- За рубежом начаты и успешно развиваются крупные проекты по мировому океану - перевод биологии в «цифру»: это и секвенирование нового поколения, и большие данные, и датчики непрерывного мониторинга, и облачные технологии, и спутниковые съемки. Нам удалось объединить знания, усилия и инфраструктуру для того, чтобы работать над проектом в экологии пресноводных экосистем на современном уровне и не отстать от стремительно развивающейся науки. Наш проект можно сравнить вот с чем: человек наблюдает через замочную скважину за окружающим миром, но вдруг массовое секвенирование распахивает дверь, и наблюдателя накрывает огромным потоком информации, - отметила Лихошвай.

Совместная работа институтов, рассчитанная на 4 года, финансируется Иркутским научным центром в рамках программы интеграционных проектов.